但朱由榔做得很巧妙，他虽然未开恩科，但在征辟过程中，却也没有绕过江南士绅，相反，如陈子龙等一批参与过抗清事业的，东林复社的中坚人物被应召入朝，一下子就把原本利益一致的士人们分裂开来，就算要喷，首先也是喷陈子龙、姜曰广之流如何“谄媚献上”，其实就是吃不到葡萄酸而已。
另一方面，让士人们更为矛盾的是，朱由榔却也没有展现出像朱元璋那种想打压文官的想法，恰恰相反，朱由榔在新年来临之际，做了一个震动整个大明朝堂和士林的制度改革。
有明一朝，内阁属于皇帝的“秘书机构”，其任免是相当随意的，而且所谓内阁职务，并非一个官员的主要职务，往往阁臣都是尚书、侍郎兼任。
但等局势稳定，堵胤锡、姜曰广两个新进阁臣回到京师后，朱由榔下旨，从此后，内阁辅臣不得兼任六部官职，六部尚书可以列席内阁会议，发表意见，但最终决策权由内阁决定。并且阁臣任免，必须由皇帝明发大诏，于大朝会之上郑重其事的进行，其中首辅的任免，还需告于太庙，所谓“宣麻拜相”。
要知道，朱由榔可是废了司礼监的，也就是说，从此以后，大明朝廷的中枢决策权都聚于内阁之手，内阁辅臣不再只是
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