校、大校称校级军官。
师长、副军长：少将，肩章为金枝一星；军长：中将，肩章为金枝两星。
另外设立上将军衔，肩章为金枝三星。上将具备指挥数个军参加战斗的权力，相当于集团军司令，在战争时期，如果需要，可临时加封为司令，指挥大型战役。
根据崇祯年间的战争状况，以及平时指挥军队的能力，第一次设立六位上将军衔，分别是第一军军长袁崇焕、第四军军长洪承畴、第十四军军长左良玉、第十九军军长沐启元、第十三军军长祖大寿、辽宁省长孙承宗。
此外，国防院提议，崇祯帝为马上皇帝，为了更好地统帅全国的兵马，加封朱由检为大元帅。
对于这样的职务，朱由本来觉得无所谓，但他考虑到，大明军人的地位肯定会提升，如果士兵将来只认识自己的将军，不认识皇帝，将军们就可能拥兵自重，设立大元帅一职，让士兵与军官随时想到，皇帝、大元帅才是军队的最高指挥官，所以也就当朝接受了国防院的加封。
国防院做出解释，实行军衔制，并不是给士兵和军官加薪，前段时间大明进行了北伐和南征，战争结束后，对前线的将士除给与物质奖励外，还根据战场的表现评定了战功，但大明使用了新
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