指挥使之外，耀武营和显武营的指挥使都被朱由检撤换了，有祖大寿担任耀武营指挥使、袁崇焕担任显武营指挥使。每营都辖一个骑兵卫和两个步兵卫。
满桂原来是宁远总兵，又是蒙古人的后裔，擅长骑射，朱由检就让他挂四武营指挥佥事衔，负值四武营四个骑兵卫的训练，由于朱由检常常不在四武营常驻，满桂是实际上的四武营最高指挥官。
四武营的训练，包括思想训练和身体技能训练。思想训练是内容有三项，主要是借用了老人家的军事思想：
一、军人以服从为天职。作为士兵，必须服从军官的管理，严格执行上级的军令，哪怕是作为诱饵，有去无回，也要不折不扣地执行。一支纪律严明的军队，在战场上才有战斗力。
二、军人的精神是勇上前线、敢打头阵、不怕牺牲。对于国内外一切敌人，军人都要有打败他们的信心和勇气，不能被建奴、蒙古这些纸老虎吓到。
三、军人的使命是保家卫国、守土开疆。养兵千日、用兵一时，军人是由国家提供军饷，战争史必须为国家浴血奋战。战后由国家论功行赏，死亡士兵的家人获得抚恤，受伤的士兵得到补偿和生活保障。
至于士兵的身体技能训练，朱由检以奋武营的
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