明军从朱元璋受封吴王元年十月至洪武三年十一月的时间里，全国军士逃亡数量已经达到了四万七千九百余人。
这种逃兵现象让大都督府警惕，傅友德也认为要严加治军，而在后续的记载中，朱元璋下达了制度化清查逃兵与缺员的行动。
先是制订连坐的条例，军士逃亡军官负责，接着派出专人领导“清军“工作，后来又在全军编造“清勾册”，清查军士员额，形成明代“清军”制度的雏形。
如“小旗逃所隶三人，降为军。上至总旗、百户、千户，皆视逃军多寡，夺俸降革。其从征在外者，罚尤严”。
此外，洪武十六年，朱元璋又命五军府檄外卫所，速逮缺伍士卒，给事中潘庸等分行清理之。
十七年，兵部尚书俞纶也上疏，称“京卫军户绝者，毋冒取同姓及同姓之亲，令有司核实发补，府卫毋特遣人”。
二十一年，朱元璋又诏卫所核实军伍。
可以说，从吴王元年到眼下，这二十几年的时间中，明军军户的逃亡是一直持续的。
如果在不懂明代军户制度的人看来，这恐怕是朱元璋苛虐军士后，军士们集体反应的体现。
毕竟洪武三年正是大明朝高歌猛进，实施第二次
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