作为从犯的前都督父子两和其他背叛她的，全部判处死刑，三日后午时在菜市口执行，家属按家主犯罪轻重，有的发配边远不毛之地，有的充作奴仆发卖。
最后投降的那些叛军也全部被分散发配各地，终身不得离开，算是实现了当初的诺言，饶他们不死。
死了的叛军不再追究其家属，在郊外边远地区挖一大坑统一埋葬，算是她的法外开恩，也是因为几万死人家属追究起来太难，数字太大，造成的影响无法预估，与其如此，不如给他们一点怜悯，也免得自己留下嗜杀之名。
趁乱偷拿宫中贵重物品准备逃跑的宫侍，按宫规处置，带头的没收家中全部财产，乱棍打死，其余的没收家中全部财产，发配渔东，一生不得离开。
因户部和礼部尚书都在渡河，所以战死的将士由木兰雨为主，留在繁都的户部、礼部官员为辅进行抚恤，处木兰雨的半年俸禄外，其余由国库支出。
对功劳较高的该追封就追封，例如战死的卫启能，追封为世袭卫辅侯，爵位级别没变，却从降级变成了世袭，谥号武毅，是武将谥号第二。
古代人对谥号非常看重，大臣都以获得谥号文正为终身追求目标，算是大臣谥号排位第一。这里的人也重谥号，分
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